主角工藤新一原本是一位颇具名声的高中生侦(🕋)探(tàn ),在(zài )(🕸)目击黑暗组织的地下交(🎹)易(yì )后,正准备追踪时却被突袭击昏,并被灌(🎲)下代号为“APTX4869”的不明药aaa。后来虽然幸免于(yú )死,但身体就此缩小为(wéi )(🗑)小学时期的模样。之后他化名为江户川柯南,在邻居阿(🔩)笠博士的建议下,寄住在女友毛利兰(㊗)的父亲—侦探毛(máo )利小五(wǔ )郎家(jiā )中(🤸),继续秘密从事追查黑暗组织的工作(zuò ),并私下探(🕙)寻获得(dé )解药的管(🤳)道,希(🕐)望能够恢复原来新一的样貌。与此(cǐ )同时,柯南凭着自己的推理天份,配合阿笠博士为他发明的(de )道具,帮助毛利小五郎成为(wéi )出名的大侦探。故事内容当中穿插许多爱情、(🏃)友情、犯罪、背叛、复仇等情节。